什么是序列表谱（profile），名词解释定义是？

名词解释序列表谱（profile）

是一种特殊位点或模体序列，在多序列比较的基础上，氨基酸的权值和空位罚分的表格。

1.名词解释模体（motif）

短的保守的多肽段，含有相同模体的蛋白质不一定是同源的，一般10-20个残基。

2.名词解释超家族

进化上相关，功能可能不同的一类蛋白质。

3.名词解释基因预测的从头分析

依据综合利用基因的特征，如剪接位点，内含子与外显子边界，调控区，预测基因组序列中包含的基因。

4.名词解释密码子偏好性（codon bias）

5.名词解释开放阅读框（ORF）

开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列。

6.名词解释自举法检验（Bootstrap）

放回式抽样统计法。通过对数据集多次重复取样，构建多个进化树，用来检查给定树的分枝可信度。

7.名词解释一致树（consensus tree）

在同一算法中产生多个最优树，合并这些最优树得到的树即一致树。

8.名词解释最大似然法（ML）

9.名词解释最大简约法（MP）

在一系列能够解释序列差异的的进化树中找到具有最少核酸或氨基酸替换的进化树。

10.名词解释邻接法（neighbor-joining method）