简述除权配对法（UPGMA）的算法思想。_考试资料网

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问答题简述除权配对法（UPGMA）的算法思想。

参考答案： 通过两两比对聚类的方法进行，在开始时，每个序列分为一类，分别作为一个树枝的生长点，然后将最近的两序列合并，从而定义出一个...

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1.问答题简述构建进化树的步骤，每一步列举1-2种使用的软件或统计学方法。

参考答案：（1）多序列比对：ClustalW
（2）校对比对结果：BIOEDIT
（3）建树：MEGA ...

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2.问答题什么是多序列全局比对的累进算法？（三个步骤）

参考答案：第一，所有的序列之间逐一比对（双重比对）；
第二，生成一个系统树图，将序列按相似性大致分组；
第三，...

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3.问答题什么是物种的标记序列？

参考答案：指物种特有的一段核苷酸序列。可以通过相似性查询，得到某一序列在数据库中的某一物种中反复出现，且在其他物种中没有的明显相似...

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4.问答题简述BLAST搜索的算法思想。

参考答案：BLAST是一种局部最优比对搜索算法，将所查询的序列打断成许多小序列片段，然后小序列逐步与数据库中的序列进行比对，这些小...

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5.问答题BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途什么？

参考答案：blastn是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行比较；Blastp是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中的序列进行比较，...

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6.问答题序列的相似性与同源性有什么区别与联系？

参考答案：相似性是指序列之间相关的一种量度，两序列的的相似性可以基于序列的一致性的百分比；而同源性是指序列所代表的物种具有共同的祖...

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7.问答题生物信息学步入后基因组时代后，其发展方向有哪几个方面。

参考答案：生物信息学步入后基因组时代后，其发展方向主要有：
①各种生物基因组测序及新基因的发现；
②单核苷酸多...

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8.问答题生物信息学的发展经历了哪几个阶段

参考答案：生物信息学的发展经历了3个阶段。
第一个阶段是前基因组时代。这一阶段主要是以各种算法法则的建立、生物数据库的建...

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9.填空题质谱的两个数据库搜索工具：（）和（）

参考答案：SEQEST；Lutkefish

10.填空题聚类分析方法，分为有（）

参考答案：层次聚类；非层次聚类