简述序列比对两种类型。_考试资料网

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问答题简述序列比对两种类型。

参考答案： （1）全局序列比：在全局范围内对两条序列进行比对打分的方法，适合于非常相似且长度近似相等的序列
（2）局部序列...

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1.问答题序列比对分类有哪些？

参考答案：

1、双序列比对：两条序列的比对
2、多序列比对：三条或以上序列的比对

2.问答题打分矩阵有哪些？

参考答案：（1）核酸打分矩阵：
等价矩阵、BLAST矩阵、转换-颠换矩阵
（2）蛋白质打分矩阵：
等...

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3.问答题如何选择合适的评分矩阵？

参考答案：一般来说，在局部相似性搜索上，BLOSUM矩阵较PAM要好
当比较距离相近的蛋白时，应选择低的PAM或高的BL...

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4.问答题简述PAM矩阵与BLUSUM矩阵的关系

参考答案：（1）两者都在打分系统中使用对数比值；
（2）PAM矩阵是基于近相关蛋白家族数据的，并且假设高度相关蛋白的取...

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5.名词解释同源性

参考答案：

两个基因或蛋白质序列具有共同祖先的结论；

6.问答题指出下列特殊标识符的格式？①序列辨认号（GI）②GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号③RefSeq序列接受号④PDB序列接受号

参考答案：①序列辨认号（GI）：一串阿拉伯数字
②GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号：
1个字母+5...

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7.问答题GBFF格式的特性表格式包括哪三个部分？

参考答案：特性表格式包含三个部分：
第一，特性关键词（Featurekey）；
第二，特性位置（Location）...

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8.问答题简述GenBank数据库中GBFF格式的结构？

参考答案：GenBank flatfile（GBFF）是GenBank数据库的基本信息单位，也是最广泛地用以表示生物序列的格式之一...

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9.问答题如何查找由Rao Y 实验室于2005以后发表的，文章主题中与brain有关的文献，写出检索语言。

参考答案：

Brain[ti] AND RaoY[au] AND 2005:2013[dp]

10.问答题下列数据库分别是什么类型的数据库？

参考答案：

序列数据库中的核酸数据库（GenBankPIRDDBJSWISS-PROTEMBL）
结构数据库（PDB）