催化底物蛋白酶由无活性状态向活性状态的转变，通常使底物蛋白质氨基酸残基（Ser，Thr，Tyr）磷酸化，从而使其活化。

与受体结合后，不引起反应，相反还抑制了激动剂与受体的结合，从而抑制了激动剂的作用。

与受体结合后，激活受体活性。

一些信号物质，除了与受体结合外，本身无其他功能。本身不参加代谢产生有用产物，不直接诱导任何细胞活性，更无酶的活性。

特指一些DNA结合蛋白，主要有转录因子和转录调节因子，在核内发挥作用，又称核内第三信使

功能是从细胞质基质中泵出H+进入细胞器，有助于保持细胞质基质中性pH和细胞器内酸性pH值。

载体质子的蛋白暂时与ATP的磷酸基团结合，使自身磷酸化而活化的质子泵。