土壤是一个生物系统，囊括了高度复杂和多样的生物体群落。‎

细菌为真核生物，古菌为原核生物，两者进化关系很远。

土壤中的水分对于生长其中的植物来说都是可用的。

富含养分的根系表面往往定殖有大量的原核生物。

土壤是空气、矿物、水和生命相交互的界面。​

土壤溶液中养分数量很少，一般需要不断从固相物质中补充。‌

植物必需元素中，植物需要量相对比较小的称为微量养分元素。‍

土壤中固相以外的空间为孔隙空间，一般被水分和空气填充。​

植物大量元素养分是土壤中含量较高的元素。‍

微生物和植物根系活性较强的地方，由于它们排出的二氧化碳较多，会增强酸化作用，从而加速矿物风化。