高灵敏度操作基线未稳定之前，柱箱检测器温度控制差；源钢瓶压力过低，使调节器不能正常工作；压阀、稳流阀失灵。

提高柱温，出峰快，分离度下降，降低温度时对分离有利，但出峰变慢，应选择适当的温度，即保证分离效率又能提高分析速度。

设定最小检出峰高、设定最小检出面积、设定更高的峰检出域值。

使用毛细管色谱柱时，为了防止样品超载，必须使用专门的分流进样器，样品在其中仅有微量样品进入毛细管柱。

随着柱温的升高，色谱柱的阻力会增大，系统载气流量会减小，为了载气流量的稳定，要使用稳流阀。

设置过小，会出现将一些基线噪声也当成色谱峰进行积分。