这种方法引入某些形式的分类系统，从而将表达模式分配到一个或多个预定义的类目中。

这种方法没有内建的分类标准，组的数目和类型只决定于所使用的算法和数据本身的分析方法。

一种通过将相似的数据划分到特定的组中以简化大规模数据集的方法。

由位点产生的突变数目把其中的一课树与其他树区分开的位点。

用枝长表示进化时间的系统树称为系统发育图，是引入时间概念的支序图。

通过序列的相似性检索得到许多相似性序列，将这些序列做一个总体的比对，以观察它们在结构上的异同，来回答大量的生物学问题。

在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步的整理。