矩阵元素是每一个字符替换概率的对数的矩阵。

一种寻找匹配子序列的序列比对方法。

DNA序列的长度单位，1000个碱基为1kb。

没有意义的DNA序列；也指那些目前还不知道其作用的序列。

在真核基因组中具有相似碱基比例的区域。

在原核生物中终止转录的特殊信号；指在新转录的RNA中可以形成二级结构的核苷酸序列，其后跟随一串尿嘧啶。

在一棵系统发生树中，不对应真正数据的节点，这样的节点代表两个或多个独立家系的公共祖先。

指除了自身转座需要外不再包含有任何信息的转座子元件；当被插入到一个基因中，它将破坏其正常的结构以及基因的功能。

真核基因中与转录起始位点密切相关的核苷酸；在人类中，该一致序列是5’-YYCARR-3’。

一系列自身相互作用的转录因子形成复合体，作用与一个基因的启动子区域，从而促进基因的转录启动。