中脑内的空腔称为中脑腔，与第三、第四脑室相通。

鱼类中脑背面的顶盖被纵行沟分为两个半球，称为视叶，视神经末端位于视叶内。

漏斗腹后方连一圆形构造，为脑垂体，是内分泌腺体。

间脑背面中央突出1条细长线状的组织，称为脑上腺或松果腺。

大脑半球内各有一脑腔，称为侧脑室。

大脑腹壁上有许多神经细胞集中而形成的，是真正的脑组织所在。

与前肾相通，此后会失掉联系，或者此管退化，软骨鱼类的米勒氏管是输卵管。

中肾小管前端扩大呈球状，前壁向内凹入形成具有两层细胞的杯状深凹，称为肾小球囊或鲍氏囊。

与中肾的肾小管相通的，担负输尿管的任务，称为中肾管或吴夫氏管，软骨鱼类的吴夫氏管是输精管。

鱼类成体的泌尿器官，呈块状组织，位于体腔背壁、鳔的背方，腹面覆有体腔上皮。