分子离子是指分子被电子轰击失去一个电子而形成的单电荷离子，是在质荷比范围内的最强峰。

进行NIST谱库检索时，若化合物和检索的结果匹配率大于90%，则该化合物一定是检索出来排序第一的那个物质。

液相色谱适合分析带荧光物质的化合物（如多环芳烃等），不适合分析不发荧光但经化学反应后可发荧光的物质。

便携式气相色谱-质谱仪在长期不使用的情况下不能长期关机，需定期维护。

液相色谱法的色谱柱比气相色谱柱短很多，所以柱外展宽（又称柱外效应）不存在。

极性溶剂所占比例对溶质的保留值和分离选择性有显著影响。

在有机质谱中，相对灵敏度表示仪器所能分析的样品中组分的最低相对含量。

采用液相色谱法紫外检测器分析样品时，选择溶剂（流动相）时要注意溶剂对紫外波长的吸收不能干扰到待测组分的吸收。

在使用GC-MS分析水中挥发性有机物或者半挥发有机物的浓度时，所分析的结果应该减去实验室纯水空白试验值。

色谱柱中如果选用较长的保护柱，可降低污染物进入分析柱的时间，且不会引起谱带扩张。