铜制剂滥用、乱用，会造成果树药害、害螨猖獗、土壤污染等问题。

单子叶植物幼芽裸露，没有叶片保护，触杀性药剂能直接伤害分生组织。

苯基酰胺类杀菌剂易产生抗性，且品种间存在交互抗性。

噻螨酮对叶螨效果好，对锈螨和瘿螨效果差。

乙螨唑对螨卵的胚胎形成以及从幼螨到成螨的蜕皮过程，对卵及幼螨有效，对成螨无效，但是对雌性成螨具有很好的不育作用。

苯并咪唑类和托布津类对澡状菌无效。

苯醚甲环唑可以用来防治苹果褐斑病无效。

土壤位差选择性，利用作物和杂草的种子或根系在土壤中位置的不同，施用除草剂后，使杂草种子或根系接触药剂，而作物种子或根系不接触药剂，来杀死杂草，保护作物安全。

四螨嗪对螨卵杀伤力高，对幼螨、若螨四螨嗪有较强的杀伤力对成螨基本无效，但能抑制雌成螨的产卵量和所产卵的卵孵化率。

叶枯唑主要用来防治真菌性病害。