甲、乙均为国有企业。2004年1月，两企业经过多次协商，达成设立国有独资企业的协议。该协议规定： （1）甲公司出资200万元，其中货币100万元，注册商标100万元；乙企业出资250万元，其中货币100万元，专利权100万元，劳务50万元。 （2）公司分别在A、B两市设立具有法人资格的分公司，独立进行经营活动。 （3）公司设立五年后，双方可抽回各自出资的二分之一。 该协议在内容上有哪些违法之处？