生物信息学章节练习(2020.05.17)
来源：考试资料网
参考答案：空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响，序列中的空位的引入不代表真正的进化事件，所以要对其进行罚分，空位罚分的多... 参考答案：它对每个可能的进化位点分配一个概率，然后综合所有位点，找到概率最大的进化树。最大似然法允许采用不同的进化模型对变异进行分... 参考答案：（1）选择菜单file，
（2）选择Text File Editor and Format Coverter工... 参考答案：核酸序列得分系统比较简单，只需要考虑匹配、不匹配及空位罚分这三种情况；而蛋白序列比对就要复杂得多，除了考虑匹配和空位罚分... 参考答案：
指分支长度和相邻节点对之间的差异成比例的系统发生树。
参考答案：
在一个带全正电的分子和另一个带全负电的分子之间发生的相互作用。
参考答案：（1）多序列比对：ClustalW
（2）校对比对结果：BIOEDIT
（3）建树：MEGA ... 参考答案：
在替换矩阵中，每个位置的打分是在相关蛋白局部比对模块中观察到的替换的频率而获得的，每个矩阵被修改成一个特殊的进化距离。
参考答案：
指源自蛋白质一级结构的α螺旋、β折叠等局部结构特征。