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填空题初级序列数据库（）；（）和（）

参考答案： GenBank，EMBL,DDBJ

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1.问答题BLAST应用有哪些？

参考答案：BLAST应用：
1.是序列分析的基础；
2.评价实验结果；
3.为实验提供新思路，...

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2.问答题如何进行BLAST结果显著性判断？

参考答案：结果显著性判断：查看E值列表；查看比对情况。
（1.E值是不是显著；
2.两个蛋白质是不是具有近似的...

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3.问答题如何处理BLAST后过少或过多的结果？

参考答案：如何处理过多的结果：限定数据库：Refseq；限定生物体；利用序列的特定部分搜索；调整打分矩阵；调整E值。处理过少的结果...

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4.问答题什么是动态规划算法？

参考答案：动态规划算法（Dynamic Programming Algorithm）是一种计算方法，它的主要思路是把一个问题分成若...

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5.问答题双序列比对方法有哪些？

参考答案：①点阵序列比较(Dot Matrix Sequence Comparison)
②动态规划算法(Dynamic...

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6.问答题简述序列比对两种类型。

参考答案：（1）全局序列比：在全局范围内对两条序列进行比对打分的方法，适合于非常相似且长度近似相等的序列
（2）局部序列...

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7.问答题序列比对分类有哪些？

参考答案：

1、双序列比对：两条序列的比对
2、多序列比对：三条或以上序列的比对

8.问答题打分矩阵有哪些？

参考答案：（1）核酸打分矩阵：
等价矩阵、BLAST矩阵、转换-颠换矩阵
（2）蛋白质打分矩阵：
等...

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9.问答题如何选择合适的评分矩阵？

参考答案：一般来说，在局部相似性搜索上，BLOSUM矩阵较PAM要好
当比较距离相近的蛋白时，应选择低的PAM或高的BL...

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10.问答题简述PAM矩阵与BLUSUM矩阵的关系

参考答案：（1）两者都在打分系统中使用对数比值；
（2）PAM矩阵是基于近相关蛋白家族数据的，并且假设高度相关蛋白的取...

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