分子图形学是进行分子模型化的一项重要技术，由于分子图形学和其它计算化学方法的相互结合，使得分子模型化方法取得成功。

在一个比对算法中，对于不相同的字符被比对时所赋予的罚分。

指在基因组中长度从5个碱基对到几十个碱基对重复序列串连出现的区域；在个体间变化可能很大。

为了实现微阵列数据共享和交流而制定的数据存储标准。

在一个固体基片上的已知位置固定了DNA探针的有序阵列。

一个甲基（—CH3）附着在一个核苷酸的含氮碱基或者蛋白质上。

序列比较算法对相同字符匹配设置的得分。

矩阵元素是每一个字符替换概率的对数的矩阵。

一种寻找匹配子序列的序列比对方法。